La Secretaría General de acuerdo a la misión institucional cumple con las siguientes funciones:
- Enumerar de manera cronológica y consecutiva los actos administrativos que sean aprobados por sala plena del Consejo Nacional Electoral
- Elaborar las actas de sala plena e informes de las demás reuniones y llevar su registro y control.
- Verificar que el contenido de los actos administrativos, demás decisiones y conceptos que son presentados a firma de los Magistrados de la corporación sean los textos propios aprobados en sala.
- Preparar y presentar bajo dirección de presidencia , el orden del día.
- Apoyar, suministrar y archivar toda la información y documentación solicitada por los Magistrados del Consejo Nacional Electoral.
- Las demás funciones que le sean asignados de acuerdo con la naturaleza y el área de desempeño de la dependencia.